A CAMQ surgiu da necessidade de qualificar a infraestrutura de pesquisa, com um laboratório com maior nível de sofisticação, automação e produtividade, capaz de atender a fins múltiplos de estudo, com maior sensibilidade analítica e precisão. A CAMQ foi criada no final do ano de 1998, iniciando suas atividades no final do ano de 1999, através de apoio das agências FINEP e CAPES através dos projetos de CT-PETRO e PROIN (Programa de apoio a Interação da graduação com a Pós-Graduação), onde foi possível adquirir seu primeiro equipamento: um espectrômetro de absorção, tornando-se um dos alicerces do Programa de Pós-Graduação em Química – PPGQuim da UFMA.  A CAMQ presta serviços de técnicas analíticas e físico-químicas especializadas à comunidade científica e tecnológica, com confiabilidade e agilidade, onde seu patrimônio é aproximado em 1,5 milhões de reais. Assim, o principal objetivo da CAMQ é realização de análises químicas e resolução de problemas analíticos nas mais diversas áreas do conhecimento. Atualmente, a infraestrutura da CAM é composta de cromatógrafo líquido de alta eficiência (HPLC), espectrofotômetro de Infravermelho por Transformada de Fourier (FTIR), equipamento de análise termogravimétrica (TG/DTA) e diferencial exploratória (DSC), espectrofotômetro na região do UV-Visível (UV-Vis), espectroscopia de emissão de plasma indutivamente acoplado (ICPE) e analisadores de carbono orgânico total (TOC) . A CAMQ tem atendido muitos pesquisadores internos e externos à UFMA, das mais diferentes áreas tais como química, física, biologia, odontologia, oceanografia, farmácia e engenharia química, mecânica e civil.

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